愛媛FCの新加入、退団選手は以下の通り。※情報は11月10日時点
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IN
| 日付 | 位置 | 選手 | 前所属 | 移籍先 | 備考 |
| 2022/1/20 | FW | 松田力 | セレッソ大阪 | 愛媛 | 完全移籍 |
| 2022/1/20 | DF | 森脇良太 | 京都サンガF.C. | 愛媛 | 完全移籍 |
| 2022/1/10 | GK | 板橋洋青 | サガン鳥栖 | 愛媛 | 期限付き移籍 |
| 2022/1/8 | DF | 鈴木大誠 | 徳島ヴォルティス | 愛媛 | 期限付き移籍 |
| 2022/1/8 | FW | 進昂平 | ザスパクサツ群馬 | 愛媛 | 期限付き移籍 |
| 2022/1/7 | FW | 大澤朋也 | 大宮アルディージャ | 愛媛 | 期限付き移籍 |
| 2022/1/7 | DF | 高木利弥 | 松本山雅FC | 愛媛 | 完全移籍 |
| 2022/1/7 | GK | 徳重健太 | V・ファーレン長崎 | 愛媛 | 完全移籍 |
| 2022/1/6 | MF | 佐々木匠 | ベガルタ仙台 | 愛媛 | 完全移籍 |
| 2021/12/29 | MF | 近藤貴司 | 大宮アルディージャ | 愛媛 | 完全移籍 |
| 2021/12/29 | MF | 矢田旭 | ジェフユナイテッド千葉 | 愛媛 | 完全移籍 |
| 2021/12/28 | DF | 大城蛍 | 浦和レッズ | 愛媛 | 完全移籍 |
| 2021/12/25 | MF | 佐藤諒 | FCティアモ枚方 | 愛媛 | 完全移籍 |
| 2021/12/23 | DF | 森下怜哉 | セレッソ大阪 | 愛媛 | 完全移籍 |
| 2021/12/22 | DF | 栗山直樹 | モンテディオ山形 | 愛媛 | 完全移籍 |
| 2021/12/22 | MF | 茂木駿佑 | FC琉球 | 愛媛 | 完全移籍 |
| 2021/10/22 | GK | 黒川雷平 | 愛媛FC U-18 | 愛媛 | 昇格 |
| 2021/9/22 | MF | 小原基樹 | 東海学園大 | 愛媛 | 新加入 |
| 2021/9/13 | DF | 小川大空 | 大阪体育大 | 愛媛 | 新加入 |
OUT
| 日付 | 位置 | 選手 | 前所属 | 移籍先 | 備考 |
| 2022/11/10 | 前田凌佑 | 愛媛FC | 契約満了 | ||
| 2022/11/10 | MF | 近藤貴司 | 愛媛FC | 契約満了 | |
| 2022/1/21 | DF | 渡邊創太 | 愛媛FC | MIOびわこ滋賀 | 完全移籍 |
| 2022/1/18 | DF | 浦田延尚 | 愛媛FC | ラインメール青森 | 完全移籍 |
| 2022/1/14 | FW | 西田剛 | 愛媛FC | 現役引退 | |
| 2022/1/9 | FW | 榎本大輝 | 愛媛FC | 名古屋 |
期限付き移籍満了
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| 2022/1/8 | FW | 石井快征 | 愛媛FC | 鳥栖 |
期限付き移籍満了
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| 2022/1/8 | GK | 岡本昌弘 | 愛媛FC | 鳥栖 | 完全移籍 |
| 2022/1/7 | MF | 山瀬功治 | 愛媛FC | 山口 | 完全移籍 |
| 2022/1/7 | MF | 森谷賢太郎 | 愛媛FC | 契約満了 | |
| 2022/1/6 | DF | 大谷尚輝 | 愛媛FC | 町田 |
期限付き移籍満了
|
| 2021/12/29 | DF | 茂木力也 | 愛媛FC | 大宮 | 完全移籍 |
| 2021/12/28 | FW | 唐山翔自 | 愛媛FC | G大阪 |
育成型期限付き移籍満了
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| 2021/12/27 | DF | 池田樹雷人 | 愛媛FC | 秋田 | 完全移籍 |
| 2021/12/27 | DF | 吉田晴稀 | 愛媛FC | 高知ユナイテッドSC | 期限付き移籍 |
| 2021/12/23 | MF | 小暮大器 | 愛媛FC | 秋田 | 完全移籍 |
| 2021/12/22 | FW | 藤本佳希 | 愛媛FC | 山形 | 完全移籍 |
| 2021/12/22 | GK | 加藤大智 | 愛媛FC | G大阪 | 完全移籍 |
| 2021/12/20 | GK | 秋元陽太 | 愛媛FC | 湘南 |
期限付き移籍満了
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| 2021/12/10 | MF | 川村拓夢 | 愛媛FC | 広島 |
期限付き移籍満了
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| 2021/12/6 | MF | 山瀬功治 | 愛媛FC | 契約満了 |
